Najčastejším problémom, ktorý vyplýva z kontrol fungovania územnej samosprávy, býva nedodržanie pravidiel rozpočtovania a účtovníctva, ale taktiež princípov transparentného verejného obstarávania. V tlačovej správe to uvádza Najvyšší kontrolný úrad SR s tým, že kontrolóri často narážajú aj na problém, ktorý súvisí s rozdelením právomocí medzi zastupiteľstvom a primátorom či starostom. V ostatných dvoch rokoch NKÚ
